Mah anche io ho avuto questo problema, guardando questa immagine http://img15.imageshack.us/f/eclipsefullmetalalchemi.png/ ero arrivato alla conlusione che fosse maschio ma poi continuando a guardare Brothrhood notavo che gli parlavano al femminile avvolte , allora mi chiedevo se era un'errore dei doppiatori o non so cosa...
ma forse perchè il peccato che rappresenta, la gelosia penso, è femminile, quindi è naturale che ci si rivolga a lui/lei al femminile.. anche dal fatto che lui/lei può assumere la forma che vuole..
che sia asessuale ha un senso... cmq me lo sono sempre immaginato come un maschio. Giustamente, nel manga l'unico homunculus femmina è Lust, perchè rappresenta il desiderio del Padre (che è maschio) verso l'altro sesso.